在第一阶段公司治理探索研究的基础上,第二阶段即公司治理基础研究阶段,实际上是我国公司治理研究的真正开始。在研究内容上,主要集中于对内部治理有效性的探索,研究方法则以大样本实证研究为主。由于股东治理是公司治理的基础,因此在内部治理研究中,学者们首先以股东治理作为研究重点,其次是高管治理,最后则是董事会治理。这与股权分散背景下的国外以董事会治理为核心的公司内部治理研究不同,我国独特的治理环境决定了我国公司治理研究的脉络和导向。